Polymorphism of prolactin (PRL), diacylglycerol acyltransferase (DGAT-1) and bovine solute carrier family 35 member 3 (SLC35A3) genes in native cattle breeds and its implication for Turkish cattle breeding


Dr. Öğr. Üyesi Eda Şeyma KEPENEK

Tez Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyolojik Bilimler Bölümü, Türkiye

Tez Danışmanı: Prof. Dr. İnci Togan

Tezin Onay Tarihi: 2007

Tezin Dili: İngilizce

Özet:

ÖZ

PRL (PROLACTIN), DGAT1 (DIACYLGLYCEROL ACYLTRANSFERASE-1) VE SLC35A3 (BOVINE SOLUTE CARRIER FAMILY 35 MEMBER 3) GENLERİNİN POLİMORFİZİMİNİN YERLİ SIĞIR IRKLARINDA İNCELENMESİ VE TÜRK SIĞIR IRKLARININ ISLAHINDA UYGULAMALARI


Sunulan çalışmada, dört yerli Türk sığır ırkı; Güney Anadolu Kırmızısı (n= 48), Doğu Anadolu Kırmızısı (n=34), Yerli Kara (42), Bozırk (n=46) ve damızlık olarak kullanılan Holstein (n=21) örnekleri, süt üretimini arttıran Prolaktin (PRL) ve Diaçilgliserol açiltransferaz 1 (DGAT1) genleri ve sığırlarda görülen genetik resesif bir hastalığa (Kompleks Vertebral Malformasyon) neden olan gen (SLC35A3) açısından çalışılmıştır. Yüksek süt verimiyle ilgili olduğu düşünülen PRL geninin A allelinin frekansının değeri 0.5645 (Yerli Kara) ile 0.7558 (Güney Anadolu Kırmızısı) arasında değişmektedir. Sütteki yağ miktarıyla ilgili olduğu düşünelen DGAT1 geninin K allelinin frekansının değeri 0.7794 (Doğu Anadolu Kırmızıs) ile 0.9250 (Yerli Kara) arasında değişmektedir. Kompleks Vertebral Malformasyon geni, çalışılan hiç bir örnekte (n= 164) tespit edilmemiştir. Sonuç olarak SLC35A3 geninin monomorfik olduğu gözlenmiştir.

İki polimorfik lokusa dayalı ikili Fst değerleri, ırkların bu iki gen açısından biribirinden anlamlı bir şekilde farklı olmadığını göstermektedir. PRL A alleli frekansı ve süt üretimi arasında ve DGAT1 K alleli frekansı ve süt yağı miktarı arasında zayıf olmakla birlikte bir bağlantı gözlenmiştir. Temel öğeler analizi (PCA) sonucunda iki polimorfik lokusa dayalı iki bileşik eksen oluşmuştur. Birinci eksendeki ırkların konumu, ırkların sütteki yağ miktarıyla tam bir korelasyon göstermiştir. Aynı şekilde ikinci eksendeki ırkların konumu, ırkların süt üretim miktarıyla gene tam korelasyon göstermiştir. Ayrica, temel öğeler analizi süt miktarina PRL A alleli gibi DGAT1 K allelinin de etkisi olabileceğini göstermiştir. Sunulan çalışmanın sonuçlarının, yerli Türk sığır ırklarının iyileştirilmesine katkıda bulunacağı düşünülmektedir.

Anahtar Kelimeler: Yerli Türk Sığır Irkları, PRL, DGAT1, SLC35A3, PCA